公司以董事长和总经理为领导核心，将公司分为四大管理部门：财务部、业务部、行政部和工程部，设立专家委员会。财务部、行政部和专家委员会由总经理直接领导，各部门对总经理负责;业务部和工程部分别委任副总经理直接管理，业务部下设：环评部、安评部、能评部;工程部下设：客户服务部、业务拓展部。

公司管理层根据四大管理部门的特殊性对组织架构进行了多次的重组，将相同类型的职能环节尽量集中于同一接口人员身上。这样有效减少了繁杂环节、避免了由于多接口造成的沟通脱节和责任推委，从而大大提高了对外反应速度。